MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 6106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011206	AT	3	6	783639	783644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011206	GC	3	6	787124	787129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_011206	GC	3	6	788090	788095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_011206	GCC	2	6	788132	788137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_011206	CGG	2	6	788174	788179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011206	AGC	2	6	788212	788217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011206	CCGG	2	8	796726	796733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_011206	GCC	3	9	796738	796746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_011206	CGG	2	6	796860	796865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011206	A	6	6	796869	796874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011206	TGGG	2	8	796894	796901	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011206	GCG	2	6	796934	796939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011206	GTC	2	6	796941	796946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011206	TTC	2	6	796989	796994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011206	GCA	2	6	801158	801163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011206	ACCA	2	8	801166	801173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_011206	AAT	2	6	803573	803578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011206	T	6	6	803619	803624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011206	AGG	2	6	803685	803690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011206	CCGA	2	8	804313	804320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_011206	GCT	2	6	805522	805527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_011206	TGG	2	6	805529	805534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011206	CTG	2	6	807336	807341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_011206	CTGCG	2	10	807361	807370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1525	NC_011206	CAG	2	6	807377	807382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011206	CTTT	2	8	808880	808887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_011206	TA	3	6	808918	808923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011206	GTT	2	6	808928	808933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011206	ATT	2	6	808944	808949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011206	AGG	2	6	809004	809009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011206	ACG	2	6	809012	809017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_011206	GAG	2	6	810017	810022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011206	AT	3	6	813199	813204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011206	ATT	2	6	813208	813213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011206	ACATT	2	10	813257	813266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_011206	AGG	2	6	814541	814546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011206	AGG	2	6	819570	819575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011206	AGG	2	6	823740	823745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011206	A	6	6	830058	830063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011206	GTG	2	6	830094	830099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011206	CAC	2	6	830109	830114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_011206	GCT	2	6	830151	830156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011206	GCC	2	6	830212	830217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_011206	AGG	2	6	832063	832068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011206	GTC	2	6	838998	839003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011206	TTG	2	6	842253	842258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011206	GCGCC	2	10	842283	842292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1548	NC_011206	CCT	2	6	847056	847061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_011206	ACG	2	6	847113	847118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_011206	CCG	2	6	847247	847252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_011206	AAG	2	6	847276	847281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011206	AG	3	6	847285	847290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011206	CGG	2	6	847350	847355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_011206	CCG	2	6	847360	847365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_011206	GCG	2	6	847407	847412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011206	GAC	2	6	847430	847435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_011206	GTG	2	6	847498	847503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_011206	TGG	2	6	847554	847559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011206	AC	3	6	847562	847567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_011206	ATA	2	6	847581	847586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011206	GGCC	2	8	847632	847639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_011206	CTT	2	6	847671	847676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_011206	T	6	6	847675	847680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011206	CCA	2	6	847686	847691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_011206	AT	3	6	847695	847700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1570	NC_011206	GC	3	6	847922	847927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_011206	GC	3	6	847931	847936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_011206	C	7	7	848021	848027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1573	NC_011206	AGG	2	6	848086	848091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011206	GCA	2	6	848103	848108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011206	TAC	2	6	848138	848143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_011206	TG	3	6	848291	848296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011206	GAG	2	6	848324	848329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_011206	CCAA	2	8	849763	849770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_011206	ATG	2	6	851347	851352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011206	T	6	6	851383	851388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_011206	T	6	6	858762	858767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011206	GGC	2	6	858806	858811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_011206	GGATGT	2	12	862879	862890	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_011206	GTG	2	6	868010	868015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_011206	CAG	2	6	868933	868938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011206	ACACT	2	10	869100	869109	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_011206	CAA	2	6	870069	870074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_011206	AAGGA	2	10	870205	870214	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_011206	AT	3	6	873680	873685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011206	GAA	2	6	873766	873771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011206	GTG	2	6	873827	873832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011206	CGAG	2	8	873847	873854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_011206	GAA	2	6	873874	873879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011206	AGC	2	6	873937	873942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011206	AAT	2	6	873943	873948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011206	A	6	6	873958	873963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011206	TC	3	6	873999	874004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_011206	CT	4	8	874005	874012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_011206	CG	3	6	874044	874049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_011206	A	6	6	874161	874166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011206	TCA	2	6	874193	874198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011206	TGGA	2	8	874218	874225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011206	A	6	6	874271	874276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011206	GAAT	2	8	875635	875642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011206	GGAC	2	8	891822	891829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_011206	GCA	2	6	891838	891843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011206	ATC	2	6	891845	891850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_011206	GCT	2	6	891853	891858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011206	GGC	2	6	891896	891901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011206	GCTT	2	8	891916	891923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_011206	AGG	2	6	892044	892049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011206	TG	3	6	892095	892100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011206	CGG	2	6	892717	892722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011206	TCA	2	6	892757	892762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_011206	CAA	2	6	892806	892811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_011206	CCA	2	6	892858	892863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1636	NC_011206	CGA	2	6	892890	892895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1906	NC_011206	TGG	2	6	1008450	1008455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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